生信小猪C
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linux中的tee命令
tee指令会从标准输入设备读取数据，将其内容输出到标准输出设备,同时保存成文件。我们可利用tee把管道导入的数据存成文件，甚至一次保存数份文件。 tee命令帮助信息 1、tee&n…
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linux shell脚本下指定截取字符与拼接
1、#号 截取，删除左边字符，保留右边字符 #是运算符#*nc表示，从左边开始删除第1个nc及左边的所有字符 string=https://www.ncbi.nlm.n…
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linux下的ehco命令
echo命令说明：http://linuxcommand.org/lc3_lts0080.phpecho 是一个内置的 shell，它执行一个非常简单的任务。它在标准输出上打印出它…
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预测蛋白质的二级结构
对于未知结构的蛋白质，可以通过氨基酸序列，预测其二级结构。 下面以PSIPRED软件为例：http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipredPSIPRED是一个蛋…
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Linux下的su命令
Linux su(英文全拼: switch user)命令用于切换成不同的用户身份。Linux系统用户有两类： 1）普通用户 2）root用户（超级用户）：root用户权限最高，可…
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linux下的xargs
xargs是在做什么的?就以字面上的意义来看，×是加减乘除的乘号，args 则是arguments(参数）的意思，所以说，这个玩意儿就是在产生某个命令的参数的意思。xargs 可以…
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在linux中使用conda管理python和包
管理 Python当您创建新环境时，conda 会安装您在下载和安装 Anaconda 时使用的相同 Python 版本。如果您想使用不同版本的 Python，例如 Python …
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更新或卸载Anaconda & Miniconda
更新 Anaconda 或 Miniconda 卸载 Anaconda 或 Miniconda 1、打开一个终端窗口。 2、删除整个 Miniconda 安装目录： 3、编辑~/….
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linux下管理conda环境
管理环境Conda 允许您创建单独的环境，其中包含不会与其他环境交互的文件、包及其依赖项。当您开始使用 conda 时，您已经有了一个名为 base 的默认环境。但是，您不想将程序…
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linux下安装conda
conda官网：https://conda.io/projects/conda/en/latest/ conda目前有两种发行版，Anaconda和Minicondaanacond…
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perl–通用量词&优先级&优先级范例&模式测试程序
十四、通用量词模式中的量词(quantifier)代表前面条目的重复次数。到目前为止，我们已经见过三个量词:*、+以及?。如果这三个量词都不符合需要，你还可以使用花括号({})的形…
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awk模式pattern
BEGIN模式是处理文本之前需要执行的操作 END模式是处理完所有行之后执行的操作 awk结合BEGIN和END模式 awk模式pattern pattern也可以理解为条件 BE…
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perl–通用量词&优先级&优先级范例&模式测试程序
十四、通用量词 模式中的量词(quantifier)代表前面条目的重复次数。到目前为止，我们已经见过三个量词:*、+以及?。如果这三个量词都不符合需要，你还可以使用花括号({})的…
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perl–绑定操作符=~&模式中的内插&捕获变量&捕获变量的存续期&不捕获模式&命名捕获&自动捕获变量
七、绑定操作符=~ 默认情况下模式匹配的操作对象是$_，绑定操作符(binding operator，=~)告诉Perl，拿右边的模式来匹配左边的字符串，而不是匹配$_。例如: 绑…
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perl–选择一种字符解释方式&锚位&单词锚位
四、选择一种字符解释方式Perl5.14开始增加了一些用于通知Perl如何解释字符意义的修饰符，着重于两个重要方面:对大小写的处理以及对字符集合简写的阐释。本节所有内容仅适用于Pe…
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perl–用m//进行匹配&模式匹配修饰符&组合选项修饰符
一、用m//进行匹配之前我们用双斜线的写法表示模式，比如/fred/。但事实上，这是m//(pattern match operator，模式匹配操作符)的简写。就像我们在介绍qw…
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在Linux下使用poppler合并pdf文件
Poppler是用于呈现可移植文档格式(PDF)文档的免费软件实用程序库。它的开发得到freedesktop.org的支持。它通常在Linux系统上使用，并被开源GNOME和KDE…
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linux下利用basename获取文件名
在linux中，文件的完整路径是指文件的完整地址，包括文件所在的目录和子目录，每个操作系统都有文件的完整路径的不同变体，在linux中看起来应该像/home/User/Docume…
